Top 10 RNA-Seq Publications of All Time

colourbox16147966rna

“RNA-Seq is the most likely NGS technique to be used by researchers in 2017 due to its versatility”

 

 

 

RNA-seq has become a ubiquitous tool in both biological and medical research. Much of the RNA-seq analysis done is still for differential gene expression from poly-adenylated mRNAs; but the success of RNA-seq can also be seen in the rapid increase in knowledge about biological systems and the large number of distinct variants of the method.  The combination of these factors allow us to go much further than the ‘simple’ 3’ gene expression microarrays and now opens up the possiblities of: splicing analysis, differential allele expression, variant detection, alternative start/stop, gene fusion detection, RNA editing and eQTL mapping to name but a few…

Continue reading Top 10 RNA-Seq Publications of All Time

Stor MR-studie viser strukturelle endringer i hjernen hos barn med ADHD

amygdala
MR-bilde av hjerne med amygdala vist i rødt.

Flere forskere fra KGJebsen-senteret har bidratt til den største studien av hjernestrukturer ved ADHD som noensinne er gjennomført. Totalt 135 pasienter og kontrollpersoner fra Bergen har inngått i studien, som nylig ble publisert i tidsskriftet Lancet Psychiatry. (Hoogman et al. Lancet Psychiatry. 2017 Feb 16. PMID: 2821962).

Studien har vakt stor interesse og har allerede vært omtalt i nyhetsmedier over hele verden.

Her er et utvalg av presseomtalene.

CBS http://www.cbsnews.com/news/mri-scans-reveal-brain-differences-in-kids-with-adhd/

Time http://time.com/4671981/adhd-hyperactivity-disorder/

Fox http://radio.foxnews.com/2017/02/16/study-links-adhd-to-neurological-disorder-not-behavioral-issues/

Washington Post: https://www.washingtonpost.com/news/to-your-health/wp/2017/02/15/attention-deficithyperactivity-is-a-brain-disorder-scientists-confirm/

CNN: http://edition.cnn.com/2017/02/15/health/adhd-brain-scans-study/

Voice of America: http://www.voanews.com/a/some-brain-areas-kids-adhd-undersized/3726756.html

ABC News: http://abcnews.go.com/Health/wireStory/kids-adhd-smaller-brain-regions-normal-45521384 (using Associated Press copy)

The Daily Telegraph: http://www.telegraph.co.uk/science/2017/02/15/adhd-brain-disorder-not-label-poor-parenting-say-scientists/

TIME magazine: http://time.com/4670266/adhd-children-brains-study-normal/

CBC: http://www.cbc.ca/news/health/adhd-brain-structures-1.3983919

NDTV: http://food.ndtv.com/health/adhd-not-bad-behavior-but-physical-illness-1660126

Yahoo News: https://www.yahoo.com/news/adhd-brain-disorder-not-just-bad-behaviour-study-233957957.html (using AFP copy)

Japan Times: http://www.japantimes.co.jp/news/2017/02/16/world/science-health-world/kids-adhd-smaller-brain-regions-normal/#.WKWbNjuLS70

New Zealand Herald: http://www.nzherald.co.nz/lifestyle/news/article.cfm?c_id=6&objectid=11802197

ADHD a ‘brain disorder’, not just bad behaviour: study
DAILY NATION – KENYA, 2017-02-16T07:11:14+01:00
People with ADHD have slightly smaller brains than those without the condition, according to a study released Thursday which insisted it is a physical disorder and not just bad behaviour. PHOTO| FILE| NATION MEDIA GROUP  In Summary The regions a…

 

ADHD A ‘Brain Disorder’, Not Just Bad Behaviour: Study
NDTV, 2017-02-16T07:51:09+01:00
ADHD A ‘Brain Disorder’, Not Just Bad Behaviour: Study Health | Agence France-Presse | Updated: February 16, 2017 11:38 IST EMAIL PRINT COMMENTS Drugs for treating ADHD have been blamed for side effects like liver damage and suicidal thoughts…
Brains of Those With ADHD Show Smaller Structures Related to Emotion, New Research Shows
KTLA 5 TV, 2017-02-16T07:58:14+01:00
People diagnosed with attention deficit hyperactivity disorder have smaller brain volume than those without the disorder, according to a study published Wednesday in the medical journal The Lancet Psychiatry. The differences in brain volume were iden…
ADHD is an actual brain disorder and not problematic children
DECCAN CHRONICLE-LATEST INDIA NEWS, 2017-02-16T07:58:49+01:00
ADHD is an actual brain disorder and not problematic children AFP Published Feb 16, 2017, 11:40 am IST Updated Feb 16, 2017, 12:12 pm IST People with ADHD have slightly smaller brains than those without the condition  The children with ADHD have…
ADHD a ‘brain disorder’, not just bad behaviour, study claims
MALAY MAIL ONLINE – MALAYSIA, 2017-02-16T05:58:22+01:00
ADHD a ‘brain disorder’, not just bad behaviour, study claims Thursday February 16, 2017 11:48 AM GMT+8                ADHD is blamed for severe and repeated bouts of inattention, hyperact…
The regions affected included the amygdala, which is involved in the regul…
THE ASIAN AGE, 2017-02-16T06:55:00+01:00
 The regions affected included the amygdala, which is involved in the regulation of emotion. Paris : People with ADHD have slightly smaller brains than those without the condition, according to a study released Thursday which insisted it is a ph…
Brains of those with ADHD show smaller structures related to emotion
CNN Wire, February 15, 2017 Wednesday 11:47 PM GMT
(CNN) — People diagnosed with attention deficit hyperactivity disorder have smaller brain volume than those without the disorder, according to a study published Wednesday in the medical journal The Lancet Psychiatry. The differences in brain volu…
ADHD a ‘brain disorder’, not just bad behaviour: study
Agence France Presse — English, February 15, 2017 Wednesday 11:30 PM GMT
People with ADHD have slightly smaller brains than those without the condition, according to a study released Thursday which insisted it is a physical disorder and not just bad behaviour.
ADHD a ‘brain disorder’, not just bad behaviour: study
THE BUSINESS TIMES, 2017-02-16T05:15:59+01:00
People with ADHD have slightly smaller brains than those without the condition, according to a study released Thursday which insisted it is a physical disorder and not just bad behaviour. PHOTO: GETTY IMAGES/ISTOCKPHOTO [PARIS] People with ADHD have…
Verschil in hersenen gevonden bij kinderen met adhd
NRC HANDELSBLAD, 2017-02-16T03:59:12+01:00
Verschil in hersenen gevonden bij kinderen met adhd Psychiatrie De hersenbouw van kinderen met adhd en autisme wijkt af. Maar het is lastig om met hersenscans een diagnose te stellen. 15 februari 2017 om 20:55 Foto ROOS KOOLE/ANP XTRA Kinderen met de…
En stor studie bekräftar nu att personer med adhd har förändringar i hjärnan. Ad…
Svenska Dagbladet, 2017-02-16T02:36:27+01:00
En stor studie bekräftar nu att personer med adhd har förändringar i hjärnan. Adhd är alltså inte bara en “etikett” som sätts på besvärliga barn eller dåligt föräldraskap. “I stället för att stötta oss så skällde de på oss&
Brains of those with ADHD show smaller structures related to emotion By Susan Sc…
Cable News Network – USA, 2017-02-16T03:04:36+01:00
Brains of those with ADHD show smaller structures related to emotion By Susan Scutti, CNN Updated 2347 GMT (0747 HKT) February 15, 2017 Chat with us in Facebook Messenger. Find out what’s happening in the world as it unfolds. Replay More Videos ….
Brains of those with ADHD show smaller structures related to emotion
NEWS RADIO 1067, 2017-02-16T03:00:55+01:00
Brains of those with ADHD show smaller structures related to emotion (CNN) – People diagnosed with attention deficit hyperactivity disorder have smaller brain volume than those without the disorder, according to a study published Wednesday in t…
Studie bekräftar hjärnförändringar vid adhd En stor studie bekräftar nu att pers…
SYDSVENSKA DAGBLADET, 2017-02-16T03:03:46+01:00
Studie bekräftar hjärnförändringar vid adhd En stor studie bekräftar nu att personer med adhd har förändringar i hjärnan. Adhd är alltså inte bara en “etikett” som sätts på besvärliga barn eller dåligt föräldraskap. “I stället för at
ADHD a ‘brain disorder’, not just bad behavior — study
PHILIPPINES DAILY INQUIRER – PHILIPPINES, 2017-02-16T03:20:52+01:00
PARIS, France — People with ADHD have slightly smaller brains than those without the condition, according to a study released Thursday which insisted it is a physical disorder and not just bad behavior. The largest analysis to date of the brain…
ADHD a ‘brain disorder’, not just bad behaviour: study
MIDDLE EAST NORTH AFRICA FINANCIAL NEWS, 2017-02-16T03:30:02+01:00
(MENAFN – AFP) People with ADHD have slightly smaller brains than those without the condition, according to a study released Thursday which insisted it is a physical disorder and not just bad behaviour. The largest analysis to date of the brains of p…
Verschil in hersenen gevonden bij kinderen met adhd
NRC.NEXT, 16 February 2017
Kinderen met de diagnose adhd hebben gemiddeld genomen een kleinere amandelvormige kern (amygdala) in hun hersenen dan leeftijdgenoten zonder diagnose. Dat blijkt uit een vergelijkend onderzoek van MRI-hersenscans van 1.713 mensen met adhd en 1.529…
‘ADHD is gewoon een hersenziekte’
Trouw, 16 februari 2017 donderdag
Mensen met ADHD (voluit: Attention Deficit Hyperactivity Disorder) hebben kleinere hersenen, waarmee het volgens een internationaal onderzoeksteam toch echt een breinziekte lijkt. Om precies te zijn vallen vijf regio’s in de bovenkamer iets kleiner…

 

Ernæring og ADHD

Det er en klar sammenheng mellom kosthold, helse og adferd. Alvorlig feilernæring og vitaminmangel kan gi nevrologiske og psykiatriske symptomer. Det har også vært antatt at kostholdsfaktorer spiller en rolle ved vanlige psykiatriske lidelser, inkludert ADHD. Det er begrenset kunnskap om sammenhengen mellom kostholdsfaktorer, vitaminstatus og ADHD symptomer, men noen studier har vist at kostholdsendringer og tilførsel av vitaminer kan gi reduksjon av ADHD symptomer, både hos barn og voksne. Elisabeth Landaas og medarbeidere ved KGJN publiserte nylig en studie i British Journal of Psychiatry Open, der de studerte blodnivået av vitaminer hos 133 voksne ADHD-pasienter, sammenlignet med 131 friske kontrollpersoner. Det viste seg  at sammenlignet med friske kontrollpersoner, var personene med ADHD overrepresentert i gruppen med lave nivåer av vitaminene B2, B6 og B9. Det er uklart om de lave vitaminnivåene kan direkte relateres til ADHD-symptomer, men det er sannsynlig at de skyldes kostholdsfaktorer som er forskjellig hos en undergruppe av ADHD-pasienter og kontrollpersonene. Kostholdsvaner etableres tidlig og uheldige matvaner fra barndommen kan vare til voksen alder. Det er mulig at dette kan utløse, forverre eller vedlikeholde ADHD-symptomer. Her kan dere lese mer: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5153567/

 

EAT word cloud, fitness, sport, health concept

Stort nytt EU-prosjekt innvilget

Betydningen av ernæring ved psykiatriske lidelser vil undersøkes nærmere i det omfattende nye samarbeidsprosjektet Eat2BNICE  (E2BN), som nylig ble innvilget 12 millioner Euro i støtte.

Dette er det største og mest omfattende EU-prosjektet med deltagelse fra Det medisinsk odontologiske fakultet i Bergen. Fra KGJN er Jan Haavik og Stefan Johansson partnere i dette prosjektet, som er det  4. store EU-prosjektet der KGJN deltar som partnere. Mer informasjon om prosjektet kommer senere.»

 

Adult ADHD and Comorbid Somatic Disease

Medical doctor pressing 'ADHD' button on virtual touch screen on blue technology background

It is well known that people with ADHD often suffer from other psychiatric disorders in addition to ADHD.

ADHD is also associated with increased risk for non-psychiatric disorders. Adults with ADHD are more likely to suffer from asthma, obesity, migraine and different sleep disorders compared to adults without ADHD. Several other disorders might be associated with ADHD in adults, but more research is needed to clarify these associations.

Treatment of medical disorders may improve ADHD symptoms. This is important to consider when assessing and treating ADHD.

 

For more information:

Adult ADHD and Comorbid Somatic Disease: A Systematic Literature Review.

 

Johanne Instanes, PhD KGJN

Hvor mye medisin blir egentlig skrevet ut i Norge?

Ved K.G. Jebsen senter for forskning på nevropsykiatriske lidelser utforsker vi hjernen på flere måter. En del av vår forskning drar nytte av forskjellige nasjonale registre, for eksempel Medisinsk fødselsregister og Norsk pasientregister. Ved de fleste registrene må man søke om å få tillatelse for å få se forskjellige typer statistikk, eller man må lese rapporter registrene selv utgir. Et unntak er Reseptregisteret hvor alle kan se og laste ned statistikk på hvor mye det skrives ut av forskjellige typer medisiner. Her kan man også “zoome” seg inn på for eksempel kjønn og fylke. Med tallene man laster ned kan man så enkelt lage grafer over hvor mye det skrives ut av en medisin.

 

Her er et eksempel med metylfenidat (som er blant annet er virkestoffet i ADHD-medisinene Ritalin og Concerta).

Tabell, TorArne_blogg_22.9.16

 

Husk at dataene sier ikke noe om hvorfor en medisin ble skrevet ut, altså hvilken sykdom eller lidelse den utskrevne medisinen var ment å behandle. For eksempel bruker man av og til antidepressiva som sovemedisin hos folk som ikke er deprimerte, og det kan man ikke undersøke nærmere i disse fritt tilgjengelige dataene.

Prøv selv på

http://www.reseptregisteret.no/

Tor Arne Hegvik, PhD student

New treatment for Alzheimer`s disease

Hand holding a Alzheimer Word Sphere on white background.

Alzheimer’s is the most common form of dementia, a general term for memory loss and other intellectual abilities serious enough to interfere with daily life. Alzheimer’s disease accounts for 60 to 80 percent of all dementia cases. In a cutting-edge treatment for Alzheimer’s disease, scientists have developed an implantable capsule that can turn the patient’s immune system against the disease: http://actu.epfl.ch/news/an-implant-to-prevent-alzheimer-s/

 

Tetyana Zayats, Researcher KGJN

KRYSTALLPRODUKSJON I MADRID

CSICMADRID_mars2016

 

Et postdoktorstipend inkluderer ofte et utenlandsstipend og tanken er at stipendiaten skal tilegne seg kunnskap som kan tas med hjem og dermed gagne både forskeren selv og forskningsgruppen.
En del av mitt utenlandsstipend fra Helse Vest finansierer et tre måneders opphold ved Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) i Madrid hvor jeg får lære å krystallisere proteiner i gruppen til professor Juan Hermoso (http://www.xtal.iqfr.csic.es/grupo/xjuan/).
Krystallisering av et protein, en tilstand hvor man tvinger proteinet fra å være i løsning til å danne fantastiske krystaller, er en forutsetning for å kunne bestemme proteinets struktur ved hjelp av røntgenstråling. Strukturen til mer en 30 000 proteiner har blitt løst ved denne metoden og gjort tilgjengelig for omverdenen via nettsiden www.pdb.org.
Å kjenne strukturen til et protein er viktig fordi det kan fortelle oss noe om funksjonen og hjelpe oss til å forstå den molekylære mekanismen både når det fungerer som det skal og når en feil i proteinet fører til sykdom.
Et av forskningsgruppen Biogjenkjennings viktigste bidrag til forskningen i K.G. Jebsens senter for nevropsykiatriske sykdommer er å finne farmakologiske chaperoner. Dette er små molekyler som på sikt skal kunne brukes i behandling av sykdommer som er forårsaket av at mutasjoner gir proteiner feil struktur. Molekylene kalles chaperoner fordi de hjelper slike proteiner til å oppnå riktig struktur og dermed gjenopprette dets – som regel veldig viktige – funksjon i kroppen.

Marte_mars2016
Proteinet jeg forsøker å løse strukturen til i samarbeid med gruppen på CSIC er fenylalanin hydroksylase (PAH). I Norge blir det hvert år født  mellom 3 og 5 barn med sykdommen fenylketonuria (PKU), forårsaket av en ikke-fungerende PAH. Disse må følge en veldig streng diett hele livet for å unngå hjerneskade. Vårt mål er å finne en medisin som skal kunne erstatte eller redusere behovet for dietten og dermed bedre livskvaliteten til mennesker med PKU.
Et utenlandsopphold er en veldig spennende opplevelse. I tillegg til faglig kunnskap gir det en unik mulighet til å lære et nytt språk, bli kjent med nye mennesker og til å oppleve en annen kultur “fra innsiden”.
Jeg har fremdeles to måneder igjen av mitt forskningsopphold og ser frem til en spennende vår!

Marte Innselset Flydal

Postdoktor i forskningsgruppen Biogjenkjenning